Por si no lo sabías, las pasarelas de pago para Shopify influyen en los costos de tu tienda en línea. También en cómo compra tu cliente, en si los pagos se aprueban o no y hasta en si puedes vender en otros países.
Dicho de otro modo: elegir mal puede traducirse en comisiones innecesarias, pagos rechazados, clientes que abandonan el carrito o problemas para operar según tu ubicación.
Por suerte, en la guía de hoy te ayudaremos a decidir cuál es la mejor pasarela para integrar a tu Shopify, considerando tu tipo de negocio y analizando también el costo real de cada una en cuanto a comisiones y tasas fijas.
Tipos de pasarelas de pago integrables con Shopify
Antes de entrar en las comparativas, te conviene comprender qué tipo de integración estás eligiendo, porque no todas funcionan igual ni tienen el mismo impacto en la conversión.
- Pasarelas directas: el cliente paga sin salir de tu tienda, por lo que le da una mejor experiencia de usuario y, en general, mayor tasa de conversión. Son las preferidas para cualquier negocio que quiera controlar el checkout al 100%.
- Pasarelas externas: el usuario es redirigido a otro sitio para completar el pago (ejemplo: PayPal Standard). Añaden un paso extra que puede generar fricción, aunque generan confianza por el reconocimiento de marca.
- BNPL (Compra ahora, paga después): tipo Klarna, Scalapay y similares, que llevan años creciendo y los datos lo confirman, ya que ofrecer BNPL puede reducir el abandono de carrito hasta un 10% y aumentar el valor medio del pedido en torno al 20%.
Comparativa de las mejores pasarelas de pago para Shopify en 2026
Vamos a la parte que más te interesa y, a continuación, para cada pasarela te diré qué hace bien, qué hace mal y para quién tiene sentido:
1. Shopify Payments: la opción nativa
Como es evidente, hay que empezar con la pasarela de pago de la propia casa. Si tienes una tienda Shopify y no estás usando Shopify Payments (y está disponible en tu país), estás pagando de más sin razón.
La ventaja principal es que elimina por completo la comisión adicional por transacción que Shopify cobra cuando usas una pasarela externa: 2% en el plan Basic, 1% en el plan Grow y 0,6% en el Advanced.
En cuanto a comisiones de procesamiento, los números son muy buenos: 2,9% + 0,30 $ por transacción en el plan Basic, 2,6% + 0,30 $ en el Grow y 2,4% + 0,30 $ en el Advanced.
Además, la liquidación llega a tu cuenta en 1 a 3 días hábiles, con payout programable para tener más control del flujo de caja.
2. Riskpaygo: para negocios de alto riesgo
Si Shopify Payments no es lo que buscas, o si tu negocio opera en un sector que las pasarelas tradicionales suelen rechazar (suplementos, productos digitales, suscripciones, negocios internacionales con alto volumen), aquí es donde entra nuestra pasarela de pago de alto riesgo.
Lo que diferencia a esta plataforma es que, aparte de aceptar lo que otros rechazan, también cuenta con infraestructura seria.
Es decir, incluye sistema antifraude con inteligencia artificial en tiempo real, soporte para más de 150 monedas, liquidaciones ágiles y sin las retenciones de fondos inesperadas que tantos dolores de cabeza generan en pasarelas más restrictivas.
Y su integración con Shopify permite activarlo sin que tengas que rehacer todo tu flujo de checkout.
3. Stripe: una infraestructura global
Stripe es la favorita de los equipos técnicos, y con razón. Su API es una de las mejor documentadas del sector y su ecosistema de herramientas la convierte en una plataforma casi completa para negocios con recursos de desarrollo.
Lo mejor es que está disponible en 46 países y soporta más de 135 monedas. Sus comisiones base son 2,9% + 0,30 $ por tarjeta, y los pagos llegan en 2 días hábiles.
El problema de integrar Stripe en Shopify es que Shopify añade su comisión de transacción encima, que es entre 0,6% y 2% según tu plan, lo que puede encarecer bastante el coste real por venta.
Para un negocio con 50.000 $ mensuales en ventas, esa diferencia puede superar los 600 $ al mes extra frente a usar Shopify Payments. Por eso, solo tiene sentido si necesitas personalización avanzada, operas en múltiples canales o tu stack técnico ya gira en torno a Stripe fuera de Shopify.
4. PayPal: como marca de confianza
PayPal no pasa por debajo de la mesa porque (nos guste o no) sigue siendo el nombre que más clientes reconocen y en el que más confían a la hora de pagar en una tienda nueva.
Lo malo es que tiene unas comisiones muy altas para ciertas transacciones y el tiempo de transferencia de fondos a tu banco puede ser de 1 a 3 días adicionales después de tenerlos en tu cuenta PayPal.
También aplica una comisión de disputa de 20 $ frente a los 15 $ de Shopify Payments o Stripe. Así que, si bien es cierto que su nombre da autoridad, también lo es que hay varios puntos que juegan en su contra.
5. Integral Pay: todos los pagos integrados
Cerramos el ranking con Integral Pay, que apunta a un problema real que muchos negocios tienen cuando crecen: la fragmentación.
Tienes Shopify Payments para unas ventas, PayPal como alternativa, quizás Stripe para suscripciones, y al final reconciliar todo eso es una pesadilla contable.
Lo que hace Integral Pay es centralizar la gestión de múltiples métodos de pago dentro de Shopify, facilitando la reconciliación y el seguimiento del flujo de caja desde un solo panel.
Es una solución muy buena para negocios con volumen medio-alto que tienen varios canales de venta activos y necesitan visibilidad consolidada sin tener que exportar CSVs de tres plataformas distintas.
Cómo elegir tu procesador de pagos para Shopify
Lo primero que debes saber es que no existe la pasarela perfecta para todos los negocios. Pero sí puedes tomar una buena decisión analizando con calma los siguientes factores:
Ubicación geográfica
Empieza por revisar qué opciones están disponibles para tu región. ¿Shopify Payments sirve en tu país? Si es que sí, empieza por ahí. Si no, Riskpaygo o Stripe son las alternativas más completas para mercados internacionales.
Comisiones por transacción
Analiza el porcentaje que cobra la pasarela y suma también la comisión adicional que Shopify cobra por usar proveedores externos. Ese 1–2% extra puede cambiar radicalmente el cálculo real de tu margen.
Soporte de divisas
No olvides revisar también las divisas con las que funciona y soporta. Si el 30% o más de tus clientes son de otro país, necesitas una pasarela que soporte conversión automática y métodos de pago locales. Una sola divisa no es suficiente para vender globalmente.
Compatibilidad con suscripciones
Si tienes o piensas tener un modelo de pago recurrente, verifica que la pasarela soporte billing automático, gestión de cancelaciones y recuperación de pagos fallidos. No todas lo hacen bien.
Cómo configurar tu pasarela en Shopify paso a paso
El proceso de activación es más sencillo de lo que parece. Esto es lo que tienes que hacer en cualquier caso:
- En primer lugar, entra en tu panel de Shopify y ve a Configuración> Pagos desde el menú lateral izquierdo.
- Ahora, activa o elige tu proveedor principal y, como te venimos mencionando, si Shopify Payments está disponible en tu región, aparecerá como opción prioritaria.
- Para proveedores externos, selecciona «Proveedores de pago alternativos» y busca el que necesitas.
- Luego, conecta tu cuenta del proveedor y Shopify te redirigirá al proceso de verificación de tu pasarela. Ten a mano tu documentación de empresa y datos bancarios.
- Después, añade métodos de pago complementarios, como PayPal Express, Apple Pay, Google Pay o BNPL.
Haz un pedido de prueba, ya que la plataforma tiene un modo de prueba que simula transacciones reales. Úsalo antes de abrir tu tienda al público para verificar que todo funciona correctamente.
Análisis de costos: ¿cuánto vas a pagar realmente por cada venta?
Aquí está la pregunta que más importa. Vamos con los números reales, sin omitir la comisión adicional de Shopify que muchos análisis ignoran deliberadamente.
Los porcentajes de la tabla corresponden a transacciones con tarjeta online en el plan Basic de Shopify. En planes superiores, la comisión de procesamiento baja y la comisión adicional de Shopify se reduce o desaparece.
| Pasarela | Comisión pasarela | Comisión Shopify | Cuota mensual | Payout (días) |
| Shopify Payments más económico | 2,9% + 0,30 $ | 0% | Incluida en plan | 1–3 hábiles |
| Riskpaygo | Variable (negociable) | 2% (Basic) | Consultar | Rápida / flexible |
| Stripe | 2,9% + 0,30 $ | 2% (Basic) | Sin cuota fija | 2 hábiles |
| PayPal | ~3,49% + cuota fija | 2% (Basic) | Sin cuota fija | 1–3 + transferencia |
| Integral Pay | Variable por método | Según configuración | Consultar | Variable |
¿Hay algo que muchos pasan por alto? Sí: el coste real de los chargebacks
En sectores de alto volumen o con productos que generan más disputas (como suscripciones o ventas digitales), este coste puede acumularse rápidamente.
Es otro motivo por el que Riskpaygo, con su sistema antifraude diseñado específicamente para reducir chargebacks en sectores complejos, es una opción que merece análisis serio.
La mejor pasarela de pagos Shopify para tu negocio digital
Si operas en sectores que las pasarelas tradicionales evitan, vendes a escala internacional o necesitas una solución sin las restricciones habituales, Riskpaygo es nuestra recomendación.
Stripe es la mejor alternativa técnica para equipos con capacidad de desarrollo y PayPal debe estar siempre como opción complementaria en tu checkout, no como opción única.
La clave está en no elegir solo una, ya que un checkout con tu pasarela principal más PayPal y Apple Pay/Google Pay puede recuperar clientes que de otra forma perderías por la falta de su método preferido.
Preguntas frecuentes
¿Puedo usar más de una pasarela de pago al mismo tiempo?
Sí, y de hecho es lo que recomendamos. Shopify permite tener una pasarela principal activa y añadir botones de pago alternativos como PayPal Express, Apple Pay o Google Pay sin coste adicional si usas Shopify Payments.
¿Cómo puedo evitar la comisión adicional de transacción de Shopify?
La única forma de eliminarla completamente es usando Shopify Payments como tu pasarela principal. Si Shopify Payments no está disponible en tu país, esa comisión es inevitable.
¿Cuánto tiempo tarda el dinero en llegar a mi cuenta bancaria?
Depende de la pasarela. En el caso de Riskpaygo, en 48 horas ya tienes el pago acreditado.
¿Qué pasarela es mejor si vendo productos de alto riesgo?
Riskpaygo es la opción más indicada para negocios que Stripe o Shopify Payments suelen rechazar o restringir: suplementos, productos digitales, suscripciones, sectores regulados o negocios con alto volumen de transacciones internacionales.
¿Necesito una cuenta bancaria en el extranjero para cobrar en dólares?
No necesariamente. La mayoría de pasarelas internacionales, incluyendo Riskpaygo y Stripe, permiten aceptar pagos en múltiples monedas y recibir la liquidación en tu moneda local. Lo que sí necesitas es verificar que la pasarela opera en tu país como adquirente o tiene acuerdos locales para poder liquidar en tu cuenta bancaria doméstica.
